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1.小肠球虫的感染：小肠球虫的感染是本病的首要原因之一。小肠球虫首要寄生于肠粘膜上皮细胞中，当其很多成长繁衍时，必定导致肠粘膜增厚，水肿，严峻掉落及出血等病变，
则简直使饲料不能被彻底消化吸收，一同对水分的吸收也显着削减，虽然鸡很多饮水，也会引起脱水现象，所以发病鸡群所排的粪便就很稀薄且不成形，内含有没有被消化的饲料。
2、细菌感染：细菌能引起肠炎，也是肉鸡肠毒综合症的病因之一：如沙门氏菌、产气夹膜梭菌等，经过影响破坏肠道黏膜，一同引起炎症使肠蠕动速度加速，消化液排泄过多，
饲料经过消化道的时刻缩短，导致消化不良。
3、病毒感染：病毒也是引起肠毒综合症的诱因之一;如呼肠弧病毒引起肠炎，危害肠道的吸收功用。
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